Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms