Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CHTOPQ9Y3Y2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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