Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
RHBDD3Q9Y3P4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHBDD3Q9Y3P4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms