Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS3Q9UNS2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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