Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZMYND8Q9ULU4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms