Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNRF3Q9ULT6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms