Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB23Q9ULC3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms