Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN1Q9ULB1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms