Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDAC9Q9UKV0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms