Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO3Q9UK99 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms