Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD3Q9UJU5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms