Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBF1Q9UH73 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms