Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms