Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms