Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VTI1BQ9UEU0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms