Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms