Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD3Q9UBI1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD3Q9UBI1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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