Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms