Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC2Q9P258 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC2Q9P258 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms