Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAMSAP3Q9P1Y5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms