Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMBRD1Q9NUN5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms