Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPMQ9NSP4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms