Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL1Q9NSC2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms