Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LTBP3Q9NS15 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LTBP3Q9NS15 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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