Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NRIP3Q9NQ35 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms