Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASCL3Q9NQ33 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms