Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HMG20AQ9NP66 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms