Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
REEP4Q9H6H4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP4Q9H6H4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms