Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB1BQ9H0U4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms