Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTDSP1Q9GZU7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms