Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms