Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLR2J2Q9GZM3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR2J2Q9GZM3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms