Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CIPCQ9C0C6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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