Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLRP1Q9C000 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLRP1Q9C000 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms