Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP2Q9BX26 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms