Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VAMP8Q9BV40 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VAMP8Q9BV40 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms