Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf50Q9BV19 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms