Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOXF2Q9BQY4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOXF2Q9BQY4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms