Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLF1Q9BQI6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLF1Q9BQI6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms