Protein–RNA interactions for Protein: Q96SA4

SERINC2, Serine incorporator 2, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC2Q96SA4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SERINC2Q96SA4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms