Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CITED4Q96RK1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms