Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CICQ96RK0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CICQ96RK0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms