Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF13CQ96RJ3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms