Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK3Q96PN8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms