Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms