Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRC1Q96M27 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms