Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms