Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CPNE2Q96FN4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE2Q96FN4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms