Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC51Q96ER9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms