Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms